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囊胚孵化通常指囊胚發育到一定程度，外面的透明帶被撐破，囊胚內的胚胎從透明帶中孵化出，即剝脫透明帶，該現象便被稱為孵化。患者進行試管嬰兒時，精子與卵子結合后逐漸開始發生卵裂，卵裂到7-8細胞階段，即第三天時通常出現卵裂胚。卵裂胚繼續發育，在此過程中可以逐漸生長出囊胚液，即囊胚腔，囊胚腔中通常充滿液體。隨著囊胚的體積進一步增大，細胞數增多，體積越來越大，外面包裹的透明帶可以變得越來越薄。當囊胚的體積增大到一定程度時，外面變得越來越薄的透明帶便可以被撐破，而后胚囊內的胚胎從透明帶中脫出，該動作便被稱為孵化。孵化完全的囊胚為6級囊胚，孵化后胚胎才開始進行著床和種植。因此囊胚的孵化是囊胚發育過程中，與進行胚胎種植前必須經過的階段，也必須出現的現象。如果囊胚無法孵化，通常無法在子宮腔內進行種植。