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棒狀桿菌屬于一大類細菌，包括多種棒狀桿菌，不同的棒狀桿菌感染，臨床選擇的藥物有所區別。具體如下：1、白喉桿菌感染：選的抗菌素是青霉素，可以肌肉注射，也可以靜脈點滴，如果對青霉素過敏，可以選擇大環內酯類的藥物，其中阿奇霉素、羅紅霉素可以用于棒狀桿菌的感染；2、假白喉桿菌、假結核桿菌感染：除白喉桿菌外，其它棒狀桿菌臨床感染的幾率較低，但偶爾可能會出現，比如假白喉桿菌、假結核桿菌引起的感染，可以選擇青霉素進行治療，如果過敏可以應用大環內酯類的藥物；3、JK棒狀桿菌感染：主要引起感染性心內膜炎，一般對于常見的抗菌藥物耐藥，可以選擇萬古霉素治療；4、分解尿素的棒狀桿菌感染：可以感染老年人、免疫功能低下人群，引起泌尿系統感染，通常選擇萬古霉素治療，此類棒狀桿菌對于常見的青霉素類、頭孢類的藥物耐藥；5、紋狀體棒狀桿菌感染：此種棒狀桿菌也同樣對于常用的抗菌藥物耐藥，一般會選擇萬古霉素、環丙沙星治療。