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磁共振能檢查神經系統，且磁共振是檢查神經系統較好的檢查手段。CT和核磁共振發明后，已經改寫神經系統的診斷學，以前神經系統的診斷靠拿小錘敲敲打打進行定位，檢查定性靠推算。而現在有核磁共振后，完全改變診斷的理念，懷疑有腦子器質性的病變，懷疑有脊髓器質性的病變，甚至于肌肉器質性的病變，均可進行核磁共振檢查。核磁共振是一個三維立體的檢查，可發現很多CT發現不了的病灶，且還有各種各樣序列檢查，可進行功能磁共振。功能磁共振對腦細胞活動、腦血流情況、腦脊液的灌注情況，均可進行詳細檢查。目前神經系統疾病的診斷發展突飛猛進，發生跳躍式的進步。