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唾液作為一種體液，通常與全身多種疾病密切有關。唾液量的檢查可以作為風濕免疫性疾病的重要指標，比如干燥綜合征，唾液量的檢查可以反映出唾液綜合征的輔助性診斷指標。唾液位于口腔環境中，唾液內菌群變化，可以反映口腔內菌群變化情況，在臨床上對口腔菌群的檢查，通常從唾液中取材。唾液作為體液內含的標志物，可作為腫瘤性疾病，或者內分泌系統疾病的重要取材位置。另外唾液中含有大量蛋白成分，與血液內的蛋白變化密切相關，因此唾液中蛋白成分以及量變化，反映血液當中的蛋白水平變化。全身其他感染性疾病，如艾滋病等，經臨床研究也可以從唾液當中取材，進行化驗和分析后可作為艾滋病的診斷。唾液由于取材方便、沒有創傷等優勢，受到臨床中越來越多的關注。