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食管癌有家族聚集性，也就是遺傳易感性，但不是直接遺傳性疾病。在食管癌的高發區，如河南林縣是食管癌高發區，大約60%的食管癌患者有家族史。在有食管癌的家族中，食管癌發生常常在同代或下2-3代發生率都比較高。但是也有大量臨床資料表明，有食管癌的患者家族中，下一代不一定發生食管癌。在高發食管癌家族中，食管癌患者細胞染色體數目和結構存在異常，食管癌發生率也比一般家庭或者一般人高許多，所以食管癌的遺傳問題很復雜。只要保持健康的生活習慣，特別是飲食習慣，遠離不健康因素，食管癌的發生概率可以降低。