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病毒性腦炎顧名思義是由于病毒進入顱內而導致的神經系統感染的疾病，必然可以出現神經系統相應的病理變化。在病毒性腦炎的診療過程中，腦脊液相關的常規生化檢查尤為重要，在疾病的診療過程中，通常是通過腰椎穿刺的方法獲取病人的腦脊液送檢，腰椎穿刺獲取腦脊液的方法在顱內感染診斷過程中是相對比較安全的。病毒性腦炎的腦脊液通常是無色透明的，當病毒性腦炎導致嚴重的腦組織損傷時，也可以出現黃色的或者血性的腦脊液。病毒性腦炎的腦脊液壓力，在正常范圍，或者輕中度升高，而白細胞素或者輕度升高，可達到（50-100）×10^6/L，早期以多核細胞為主，8-48小時之后以淋巴細胞為主，表現為單核細胞為主。糖和氯化物含量基本正常，蛋白會稍微升高，在腦脊液涂片或者培養檢查過程中發現不了細菌，就是無菌性的腦脊液變化。部分患者腦脊液病毒核酸檢測陽性，病毒培養及特異性抗體測試出現陽性，病毒病原學檢查，檢查出感染病毒，對治療、用藥具有指導意義。