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所有的組織切片做法大同小異，大多經過如下的制作程序。首先病理醫生將接收到的手術切除的病變組織標本，及患者的信息仔細核對無誤后，再細致觀察標本。 小標本通常全部包埋，大標本將按照規范要求選取病變組織及周圍組織，多處取材，并將其切成適宜大小的組織塊，就像切土豆片，把它切成薄薄的片狀。 較理想的組織塊大小約為2×2cm的長寬，0.2-0.3cm的厚度，以便固定液能夠迅速而均勻的滲入到組織中。 之后用酒精把組織中的水分脫掉，再進行浸蠟，使柔軟的組織固化，即使組織變硬，隨即石蠟包埋成蠟塊，再進一步用專業的切片機制成石蠟切片，并進行染色分辨，最終做成能在顯微鏡下觀察細胞形態結構的病理切片。 優良的病理切片是病理診斷正確的首要前提，有研究顯示，在大醫院中接受的疑難病理會診，50%以上并不是原來的診斷有多困難，而是切片不良所導致，所以提高病理切片的質量非常重要。