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自身免疫性腦炎就像周圍神經病的處理原則一樣，分為能找到病因，還是找不到病因。第一個能找到病因的比找不到病因的相對預后好一些；第二個取決于發現和干預時間，比如很多人患自身免疫性腦炎，最大的特征就是認知能力減退、癲癇發作兩種癥狀；還有精神癥狀，尤其是第三個精神癥狀，如果發生在年輕人，很多人會被當成精神病送到精神病院，確實有一部分病人非常難以區分，是精神病還是自身免疫性腦炎，要借助很多科學的手段來判斷，第一個是醫學正在發展的過程中；第二個是能接觸到的外送抗體局限性，不是每一個醫院都能做所有的抗體檢測，以及疾病發生動態變化特異性。比如在發生過程中，如果這個疾病在不明顯的時候，誰也不認識，發展到非常明顯的時候，也許大部分人都認識。在這種從不明顯到明顯的也許就是0%的區分度、1%的區分度、10%的區分度、50%的區分度、80%的區分度，所以這些東西都對這個疾病有很大的影響。干預的時間性，如果時間過長的干預，其實沒有很大的必要。干預手段的局限性，因為像這一類的病人，如果要去干預他，確實要經過一個漫長的過程，原來收治過一個腦炎的病人，這個病人應該是確診的，不管是他做的抗體還是最后的反應來看，但是從用藥到發生作用歷經了將近40天，距最長的報道有長達153天才有作用，就是說他40天都在昏迷，到第40天無緣無故他就起來了，他就醒過來了，這個是自身免疫性腦炎非常有趣的地方，也是非常考驗人的耐力的地方。