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間質性肺炎和新型冠狀病毒導致肺炎，主要區別在于導致肺炎的致病體，新型冠狀病毒感染導致的肺炎是新型冠狀病毒導致，而間質性肺炎通常可以是非新型冠狀病毒感染導致，可以是真菌感染導致，可以是衣原體、支原體、卡他莫拉菌、流感嗜血桿菌、軍團菌導致的間質性肺炎，可以是真菌感染導致。因此任何原因導致的間質性肺炎，和新型冠狀病毒感染導致的肺炎，最大區別在于導致肺炎的病原體不一樣。新型冠狀病毒感染診斷依據需要核酸檢測陽性，需要血清新型冠狀病毒抗體(IgM檢測)陽性，如果兩者都為陽性，新型冠狀病毒感染導致的肺炎可以確診。如果核酸檢測陰性，但新型冠狀病毒血清抗體(IgM檢測)陽性，同樣可以確診患者是新型冠狀病毒感染導致的肺炎，但其他病原菌、病毒導致的間質性肺炎，核酸檢測應該是陰性，血清抗體檢測(IgM抗體)也應該是陰性。