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隨著肺移植手術技術、供體保存和圍手術期處理的逐漸成熟，肺移植1年生存率，從過去70%提高到現在85%，但是遠期生存率無明顯升高，此提示肺移植所面臨的主要問題，受體和供體生物學不相容性。 在肺移植后的第一年里，感染是死亡主要原因，受體對于細菌、真菌、病毒、寄生蟲存在的感染高風險，急性感染在移植后1年相對少見，移植1年后主要死因,共同存在。 慢性排斥、感染和其它并發癥，肺移植術后生存時間，各種疾病各不相同，最長術后生存可達到20年，而術后3年生存率平均在50%-60%之間。