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造血干細胞移植以后，外界的東西在體內置活都要受到排斥，因為自身有自己的保護反應，會免疫排斥。造血器官和其它的實體瘤器官不完全一樣，因為既是個造血器官，又是個免疫器官，有雙向排斥。 移植物抗宿主病，排斥分急性和慢性，急性的是100天之內，叫急性GVHD，往往來勢比較兇險，起病比較急，癥狀比較重。主要癥狀表現為皮疹、口腔潰瘍、胃腸黏膜損傷、腹瀉、惡心，因為有腹瀉，有時出現感染、發熱，這時與感染不好鑒別。有時需要應用試驗性治療觀察，也有的時候因為不能排除，特別是移植以后免疫力低下，不能等待，有時要加抗感染的藥物。肝臟改變，如引起腹水，出現黃疸，極個別時，有條件的單位可以做干細胞穿刺活檢，病理進一步診斷。 慢性GVHD即超過100天，這時患者癥狀相對比較輕，但是有的也會出現皮疹、腹瀉，但可能不像GVHD那樣對生命造成危險，加適當的抗免疫排斥藥物即可。