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核酸檢查陽性代表體內可能存在某種病原體，而核酸檢測陰性代表體內可能無此種病原體。以乙肝病毒的感染為例，若檢測發現乙肝病毒的核酸為陽性，意味著體內存在乙肝病毒，需要進一步評估肝臟是否發炎、纖維化或肝癌等。同時注意肝外器官是否損傷，如腎臟病變，是否出現蛋白尿等。若核酸檢測為陰性，基本排除病人體內存在乙肝病毒，無傳染性。所以核酸檢測是用來評估病人的體內是否有病原體的重要指標。可以用來直接判斷是否有傳染性以及是否需要進一步治療。但并非核酸結果為陰性則不需要治療，需要結合其他臨床表現綜合判斷，需要具體情況具體分析。