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診斷慢性胰腺炎一般會通過詳細了解病史、體格檢查、輔助檢查綜合判斷，首先會詢問患者病史，既往有沒有膽石癥、糖尿病、高脂血癥，平時有沒有腹痛、脂肪瀉、血糖偏高。通過內科查體、實驗室檢查，可以觀察胰腺內分泌、外分泌功能有無問題，還可進行基因檢測。 此外，通過B超檢查觀察胰腺形態有沒有改變，還可以通過CT或磁共振檢查看胰腺結構有沒有異常，胰管有沒有擴張，胰腺有沒有萎縮，甚至可以做MRCP，看有沒有胰腺、膽管病變。有時會做超聲內鏡，它對慢性胰腺炎更加敏感，因為超聲內鏡下可以通過細針穿刺抽吸，可以與胰腺癌相鑒別。診斷困難時，甚至可能會用到內鏡下胰膽管造影。綜上，診斷慢性胰腺炎依靠是B超、CT、磁共振、ERCP、MRCP，次要診斷包括腹痛、淀粉酶升高、胰腺內外分泌功能異常。