急性前列腺炎選擇抗菌藥物原則上根據尿液或前列腺液培養結果選擇敏感抗菌藥物。 　　但由于細菌培養需要時間，在等待期間，應及時選用足量、高效的廣譜抗菌藥物，如頭孢菌素類抗菌藥物，以控制病情發展。如不適宜應用此類藥物者，還可以選用磺胺類藥物，如復方新諾明或SASP進行治療。經治療若細菌對該藥敏感，癥狀好轉者，可繼續用，以防轉變為慢性。此外，患者還可根據情況先選用慶大霉素、妥布霉素、氨芐青霉素治療，再根據細菌培養和藥敏試驗選藥。