尿道畸形在臨床上分為以下幾類，為尿道下裂、尿道上裂、尿道狹窄。

　　尿道上裂、尿道下裂兩者都是一種先天性的陰莖發育畸形，是由于尿道海綿體及前段尿道有不同程度的缺陷所造成，主要表現為：尿道外口位于陰囊或陰莖的任何部位(除遠端龜頭中央)，甚至會由于尿道表皮發育不全出現陰莖向下彎曲。

　　尿道上裂是尿道和膀胱頸部的一種先天性畸形。發病率在男性為1：117000。大約每30000個新生兒中有1例。女性尿道上裂更為少見。男女比例約為5：1。男性尿道上裂中大約70%合并有尿失禁。根據尿道口的位置，在男性可將尿道上裂分為龜頭型、陰莖型和完全型三種。女性則不易診斷，因為其外部特征(陰蒂分裂)只有在仔細檢查外生殖器時才能發現。

　　尿道上裂是由于生殖結節的成對原始的遷移缺損引起的。它包括尿道的背側壁缺損、正常尿道陰莖背部的粘膜條所代替并延伸到膀胱，從而導致括約肌功能失調及尿失禁，髖骨向外旋轉導致恥骨聯合分離、增寬。恥骨的分離導致陰莖恥骨聯合偏斜，結果為陰莖向上且彎曲。

　　尿道下裂是泌尿生殖系統比較常見的先天性發育異常，指的是尿道異位開口于尿道腹側。

　　病癥是于胎兒期間發生，外生殖器和尿道在胚胎8周開始發育，15周完成，尿道溝沿著陰莖腹側表面由近端遠端逐漸融合，形成尿道，直至陰莖龜頭部。由于胎兒睪酮缺乏或其作用不足，尿道溝未完全閉合到陰莖頭的尖部，停頓于不同階段而發生不同類型的尿道下裂，又因尿道溝是由近端向遠端融合，故遠端尿道下裂更多見。

　　據統計，尿道下裂發生率為每300例男性兒童中有1例，目前已知婦女在妊娠期使用雌激素和孕激素能明顯增加其發生率。盡管人們已認識到尿道下裂有家庭史，但還不知道其遺傳特性。

　　男性尿道狹窄是泌尿外科常見病，病因有三類：①先天性尿道狹窄，是由于尿道發育障礙所致的先天畸形，如先天性尿道外口狹窄、尿道瓣膜、精阜肥大，尿道管腔先天性縮窄等;②炎癥性尿道狹窄，是尿道炎癥的后遺癥，特異性尿道感染和非特異性尿道感染均可引起;③外傷性尿道狹窄，多因尿道損傷嚴重或初期處理不當，瘢痕攣縮所造成，實際上是尿道外傷的后期并發癥。