三期梅毒又稱晚期梅毒，發生在感染的2年以后，大約有40%未經治療的梅毒病人可發展為晚期梅毒。一般于感染后10~30年可侵犯心血管和神經系統。晚期梅毒的特點是傳染性很小，但對組織的破壞性較大，嚴重時可危及生命。現將其表現分述如下：

　　1、皮膚黏膜損害 主要有結節性梅毒疹、樹膠腫及近關節結節。

　　（1）結節性梅毒疹 結節如黃豆到蠶豆大小，集簇成群，高出皮面，觸之較硬，表面呈古銅色。多見于前額、臀部、四肢等處，排成環狀、多環狀或蛇形。有的可自然消失，遺留小的萎縮斑。有的表面發生淺在潰瘍，邊緣堤狀隆起，持續時間比較長，愈后留下淺瘢痕，而在邊緣又發生新的小結節，癥狀不明顯。

　　（2）樹膠腫 又稱梅毒瘤，較結節性梅毒疹少，損害多為一處，也可多處。常見于四肢伸側、前額、胸骨部及臀部。初起時，皮下出現硬結，表面呈暗紅色斑塊。其中心以后漸軟化壞死，形成潰瘍，并逐漸深且擴大。潰瘍表面有少量似樹膠狀黏稠膿液，常一面愈合，一面繼續發展，呈腎形或馬蹄形。上腭及鼻中隔黏膜樹膠腫可以侵犯骨質，排出死骨，發生上腭、鼻中隔穿孔及鞍鼻。少數患者可以發生喉樹膠腫及樹膠腫性舌炎，引起呼吸困難，發音不清。

　　（3）近關節結節 結節發生于髖關節、肘關節、膝關節及坐骨關節等大關節附近的皮下，常對稱發生，比較堅硬，直徑可逐漸增大到1~2厘米。結節處皮膚無炎癥，壓迫結節時有輕度痛的感覺。

　　2、三期骨梅毒 與二期骨骼損害基本相似，不對稱，疼痛較輕，病程較慢，極少數病人可因長期骨膜炎而發生癌變。

　　3、晚期心血管梅毒 未經治療過的梅毒病人，約有10%發生心血管梅毒，這對患者的健康及勞動能力有嚴重影響，甚至導致死亡。在心血管梅毒中占比例最大的是梅毒性主動脈瓣閉鎖不全和梅毒性單純性主動脈炎，其次是梅毒性主動脈瘤和梅毒性冠狀動脈口狹窄，極少數可發生心肌樹膠腫。

　　4、晚期神經梅毒 晚期梅毒中約10%為神經梅毒，一旦發生則治療很困難，預后很差。其中部分為無癥狀神經梅毒，雖然腦脊液有異常變化，但沒有神經系統的癥狀。如為腦膜血管梅毒，可出現偏癱、失語。如為腦實質梅毒，則表現為脊髓癆、麻痹性癡呆和現神經萎縮，并出現一系列嚴重癥狀。

　　5、晚期眼梅毒 少數病人出現虹膜睫狀體炎、視網膜炎及角膜炎等，可導致失明。

　　6、晚期潛伏梅毒 病期在2年以上，梅毒血清反應陽性，無明顯癥狀。部分患者可復發成晚期顯性梅毒，其表現如上所述，一般無傳染性，但孕婦可通過胎盤傳染胎兒，引起胎傳梅毒。