本病的病原體是人類乳頭瘤病毒(HPV)。屬DNA病毒。病毒顆粒直徑為50～55nm。這是非常小的，一般光學顯微鏡是不能看到的，只有借助電子顯微鏡才能看到。近年來分子生物學技術研究發展迅速，證實人類乳頭瘤病毒有40種以上的抗原型，即這一家族里有40多個相似而又不同的病毒。尖銳濕疣與尋常疣、扁平疣、絲狀疣、掌跖疣等，同為感染人類乳頭瘤病毒(HPV)引起。但不同類型的HPV能引起不同的疣。如Ⅰ型主要引起掌跖疣，Ⅱ型主要引起尋常疣，Ⅲ型主要引起扁平疣，而尖銳濕疣主要是由Ⅵ型、Ⅺ型病毒所引起。HPV在溫暖潮濕的環境中特別易生存增殖，故男女兩性的外生殖器是最易感染的部位。