非淋菌性尿疲乏炎癥狀雖不十分明顯，但如不及時治愈，日久將有出現并發癥危險，故應及時到有條件的醫院診治。不要向醫生隱瞞病史，也不要自己濫用抗生素，以免延誤治療。只要配合醫生治療，嚴格遵守醫囑，非淋菌性尿道炎是可以治愈的。

　　由于沙眼衣原體具有獨特的生物學特征，對其感染的治療用藥也有特殊的要求，由于沙眼衣原體的生命周期較長，所用的抗生素療程應延長或使用半哀期長的抗生素，體外藥每試驗，大環內酶數對沙眼衣原體的作用具有較強的殺菌作用，新型喹諾酮數藥等對沙眼衣原體的作用不一。

　　臨床治療非淋菌性尿道炎要求早期診斷、早期治療、足量足療程并有針對性的聯合用藥治療，以防止產生并發癥。

　　一些患者早期治療不規則、不徹底或者在治病期間仍繼續有性行為，造成反復發作或癥狀不消失。而有些患者癥狀消失，表面上看起來已痊愈。這二種情況都應注意。

　　非淋菌性尿道炎的治愈標準是：自覺癥狀消失，尿沉淀物涂片檢查無白細胞出現，碘染色涂片為陰性等。只有醫院的化驗結果才是衡量治愈與否的根據，患者不能以自己的感覺而隨意中斷治療。治療結束后，也要根據醫囑定期到正規機構復查，以觀察有無復發。