男性不育有很多原因，先天性問題較大，后天性比較容易克服，只要醫療得法，還是有機會再先生機。

　　以內科疾病為例，如糖尿病及有些神經系統的疾病，會引起性無能，也會造成精蟲產量減少。肺結核引起的副瞘丸炎和前列腺炎，都會使精蟲的輸送發生問題，如果患者常罹患慢性鼻竇炎、慢性支氣管炎及細支氣管擴張癥，這些癥狀有時和精蟲無力癥或組織囊狀纖維化癥(造成雙側輸精管缺損)有關。青春期后的腮腺炎有時會引起瞘丸炎，使瞘丸失去制精能力。

　　長期大量服用煙酒會造成精液品質下降。吸食大麻、海洛因也會影響男性生育力。最近六個月有無發燒超過38.5℃，如果發燒超過38.5 ℃，會抑制精蟲的制造達六個月之久，并且發燒也會破壞精蟲dna。

　　有一些藥物會造成精蟲暫時性或永遠性的減少，像一些賀爾蒙制劑，如男性賀爾蒙、女性賀爾蒙、類固醇等一些治療泌尿道感染的藥物，如 nitrofuratoin;治療痛風的藥物如秋水仙素、治療潰瘍性結腸炎藥物，如sulphasalaz inel(一種黃胺劑)，會造成精蟲數目暫時性的減少。孕婦食用或暴露在女性賀爾蒙或類女性賀爾蒙添加物，會生下生殖器異常或瞘丸制精能力低的男孩。為使身材健美而服用男性賀爾蒙也會造成精蟲數目下降。

　　一些治療癌癥的化學藥物也會對生育能力造成影響;放射線治療會對生育功能造成不可恢復性的傷害，對于這些病人事先將精蟲冷凍起來以備日后之需有其需要。

　　另外，最近半年內有無為了外科手術接受全身麻醉、有無接受瞘丸切片手術，這些都會暫時抑制瞘丸制精能力。曾經接受前列腺切除手術、膀胱頸口因阻塞手術的病人，有時會造成逆行性射精造成無精液癥。尿道口因外傷造成狹窄也會造成精液不能射出。

　　尿道下裂癥或尿道上裂癥在重建手術之后有時會造成射精困難。疝氣的手術有時會造成輸精管的阻塞。輸精管結扎或切除手術會造成抗精蟲抗體的產生，這些使得輸精管再接通手術的效益打折扣。成功的精索靜脈曲張手術之后，精液品質還是沒有改善，則要找出其它造成不育的原因。

　　重復的泌尿道感染，像前列腺的感染，會傷害到生殖器官，而影響精液的品質。性病，如梅毒、淋病、單純性皰疹病毒及人類乳突病毒的感染，都會造成男性不育。皰疹病毒及人類乳突病毒會降低精蟲活動力。

　　瞘丸曾經受到外力傷害，偶爾是造成不育的原因，這主要是因瞘丸外傷造成瞘丸血腫或瞘丸萎縮，單側瞘丸外傷會經由抗精蟲抗體的產生，影響另側瞘丸所制造精蟲的功能。在青春期前或青春期是否曾有陰囊腫脹劇痛的經驗，這表示可能是瞘丸扭轉，瞘丸扭轉超過六個小時沒有緊急開刀會造成生育能力下降。隱瞘癥也和不育的嚴重程度有關系。

　　長期暴露在高溫下工作，如長時間駕駛或常洗三溫暖，都會造成瞘丸裂精能力下降。慢性接觸重金屬物，如鉛、鎘、汞，或殺蟲劑、除草劑、含碳酸硫化物，都會降低生育能力。